
หลังจากรอดชีวิตจากภารกิจที่ล้มเหลว อีธาน ฮันท์ ต้องหลบซ่อนตัวจากสายตาของโลก ขณะที่ดิ เอ็นทิตี้ยังคงเรียนรู้และพัฒนาตัวเองอย่างไร้ขีดจำกัด มันสามารถทำนายการเคลื่อนไหวของมนุษย์ได้ล่วงหน้า ทำให้ทุกแผนการของไอเอ็มเอฟแทบไร้ค่า
ลูเธอร์และเบนจี้พยายามหาทางตัดขาดการเชื่อมต่อของดิ เอ็นทิตี้ แต่ยิ่งเจาะลึกเท่าไร ก็ยิ่งพบว่ามันฝังรากลึกเกินกว่าจะลบได้ง่าย ๆ การต่อสู้ครั้งนี้จึงไม่ใช่การบุก แต่คือการเอาตัวรอดจากระบบที่รู้จักพวกเขาดีกว่าตัวเอง